上述科研處處長介紹，“985工程”和“211工程”都是國家通過經費投入支持高校建設的重點項目。其中，“211工程”側重以學科為重點支持，目前，有112所高校入圍;而列入“985工程”的高校數量較少，目前共39所，資金使用更為密集，以能力建設為重點，希望整體提升入圍高校的辦學實力。

他認為，即便網上傳聞成真，乃至未來，國家啟動新的“985后”高校建設項目，都是正常的。例如，為落實胡錦濤在清華百年校慶講話精神，教育部、財政部決定啟動實施的“2011計劃”(高等學校創新能力提升計劃)就是另一種國家重點項目，意在通過打破現有學科、行政格局局限，在關鍵領域上通過協同創新取得突破。

由于“985工程”和“211工程”高校已暫停“招新”，有業內人士向新京報記者透露，當前，沒被納入“985工程”和“211工程”的高校，就希望能在“2011計劃”協同創新臺申報上取得突破。但上述教育部官員表示，“985工程”和“211工程”重點是投資高校整體，但“2011計劃”主要投資的是協同創新臺，范圍顯得小得多。

該官員認為，根據黨的十八屆三中全會中關于深化教育領域綜合改革的決定精神，未來，教育部將逐漸減少專項經費撥款，以增強高校的辦學自主權。

另一名要求匿名的985工程高校內部人士也透露，在學習已有清華大學、北京大學綜合改革方案的過程中也發現，有高校已提出，希望國家將“985”“211”等類似高校建設項目經費轉為日常撥款，由高校自行統籌劃分，算是政府在高校撥款改革上放權給高校的嘗試。