齊魯醫藥學院前身是由萬杰集團1995年投資舉辦的民辦山東萬杰醫學院，1999年經國家教育部正式批準為具有學歷教育資格的民辦普通高等院校??民辦山東萬杰醫學高等專科學校。2008年4月經國家教育部批準升格為全日制普通本科高校??山東萬杰醫學院。2008年12月，經中國證監會許可，山東省商業集團有限公司(魯商集團)重組萬杰集團下屬的山東萬杰高科技有限公司，山東萬杰醫學院正式由魯商集團接管。學院舉辦者變更為魯商集團，學校由民企辦學轉變為國企辦學。2012年6月經山東省人民政府學位委員會評審，學校建設成為學士學位授予單位，現可授予醫學、理學、工學、經濟學、管理學學士學位。4月，學校更名為齊魯醫藥學院。

學校現設有臨床醫學、醫學影像學、護理學等31個本、專科專業，其中本科專業20個，全日制本專科在校生1.3萬余人，教職工900人，固定資產9.7億元，教學儀器設備總值10086萬元，館藏圖書110余萬冊。擁有1所直屬附屬醫院、6所非直屬附屬醫院、6所本科臨床教學醫院等120余家教學實醫院。

建校以來，學校堅持內涵發展，建成2個省級示范建設專業、2個省級優勢專業、3個省級專業、2個省級教學團隊、1個省級重點實驗室、1門國家級精品課程、1門國家級精品資源共享課程、14門省級精品課程。2013年藥學專業被教育部確定為“本科教學工程”地方高校第一批本科專業綜合改革試點專業。成為山東省民辦本科名校立項建設單位。

學校秉承“允理允能，精益求精”的校訓，堅持“施優教服務人民”的辦學宗旨，立足山東，面向全國，為現代經濟社會發展和醫療衛生事業培養醫學專門人才。