內蒙古醫科大學現在有3個校區，分別為內蒙古醫科大學金山校區、新華校區、錫林校區。

內蒙古醫科大學坐落于內蒙古自治區首府呼和浩特市，是一所以醫學為主，集理學、管理學、工學、文學于一體的多科性高等醫藥院校。經過50多年的建設和發展，內蒙古醫科大學為國家培養各級各類人才7萬余名，為自治區經濟發展、社會進步、科技創新、文化傳承、民族團結、邊疆穩定做出了重要貢獻，已成為一所具有鮮明辦學的地方高等醫藥院校。

內蒙古醫科大學校區地址及簡介

1、內蒙古醫科大學金山校區

地址：內蒙古自治區呼和浩特市金山開發區金山大道(牛牛營村)

2、內蒙古醫科大學新華校區

地址：內蒙古呼和浩特市新華大街5號

3、內蒙古醫科大學錫林校區

地址：內蒙古自治區呼和浩特市錫林

截至2016年8月，學校有金山校區、新華校區、錫林校區三個教學園區，總占地面積1230141方米，總建筑面積453591方米。其中，教學行政用房面積203636方米。教學科研儀器設備總值35343.22萬元，各類圖書文獻105萬冊(種)。2007年，學校順利通過國家教育部本科教學工作水評估，被評為“優秀”等次。