牡丹江醫學院有1個校區，牡丹江醫學院本部。

牡丹江醫學院是黑龍江省東南部地區唯一一所省屬普通本科醫藥院校。2010年被列為黑龍江省應用型本科院校建設單位。2012年被評為全國首批卓越醫生教育培訓計劃項目試點高校。2013年獲得碩士學位授予權。學校坐落在牡丹江，占地面積77萬方米，建筑面積34.1萬方米，教學科研儀器設備總值1.38億元，資產總值6.08億元。

牡丹江醫學院：

牡丹江市愛民區通鄉街3號，截至8月，學校占地面積77萬方米，建筑面積34.7萬方米，學校圖書館館藏文獻130萬冊，教學科研儀器設備總值2億元，資產總值8億元。開設20個本科專業，涵蓋醫學、理學、工學和管理學4個學科門類。有教職工2901人，其中具有副高級以上職稱510多人。

院系設置