云南省共有22所二本批次招生的大學參與了2016云南二本大學排名，其中排名第一的是云南民族大學，排名第二的是云南師范大學，排名第三的是昆明醫科大學，排名前10的二本大學還有云南中醫學院、昆明理工大學、西南林業大學、云南財經大學、云南農業大學、云南警官學院、大理大學。

以下是云南二本大學排名2016具體榜單，根據理科二本錄取均分排名，包含部分專業在二本招生的一本大學。